Если продавать/покупать по одной, то комиссия 0.01$, ежели пачками, то комиссия стандартная.. при расчете на заявках она отображается как будто продаешь по одной... В общем не верно считает

Считает всё верно. Просто рассчитывает максимально возможную комиссию которая сложится в случае если все ваши продаваемые акции продадутся не разом, а по одной акции. Одна акция - одна сделка - одна комиссия.