Налог рассчитывается исходя из рублевых сумм. Т.е. хоть вы и покупаете/продаете в долларах, для налоговой эти операции исполняются в рублях. Т.е. налог платится 1 раз. Насчёт комиссии - да, и по акциям, и по валюте.

Налог берётся при выводе средств и с дивидендов, разве не так?

Налог будет браться, когда будешь рубли на карту выводить