$TXG $ILMN С момента своего создания в 2009 году секвенирование одноклеточной РНК (RNA-seq) было основным двигателем прогресса в биомедицинских исследованиях. По большому счету изучать 37 триллионов клеток нет никакого смысла. (как считают ученые в этой области). Если брать процесс зачатия, то так же, там существует всего несколько клеток. Они считают, что одиночная клетка может дать начало целому организму, так же, как и отдельная клетка может развиться до рака или множества других болезней. Сам процесс подготовки к секвенированию очень сложный состоит из: 1) Препарирования 2) Инкапсуляция капель 3) Молекулярное препарирование и амплификацию 4) Секвенирования droplet encapsulation Инкапсуляция капель стратегия значительно увеличивает скорость реакции и значительно снижает стоимость. Сама инкапсуляция клетки предполагает 3 системы: inDrop, Drop-seq, 10X. Среди этих 3 систем, можно выделить 10x. Если не вдаваться в результаты отчетов иследований, система 10x превосходит по многим параметрам inDrop, Drop-seq. (Высокое заполнение, скорость захвата клетки, эффективность захвата мРНК (человеческие эмбрионы, требуют эффективного захвата клеток), эффективность считывания, низкие уровни шумов и прочее) Чувствительность обнаружения генов является фундаментальным показателем эффективности scRNA-seq, 10x имеет самую высокую чувствительность захватив в среднем более 17000 транскриптов от ~ 3000 генов. В исследовании говорится, что все зависит от цели и стоимости экспериментов. Хотя большинство проектов работают с относительно большим количеством клеток, ценные образцы, такие как человеческие эмбрионы, требуют эффективного захвата клеток. Как показывает практика, 10X в настоящее время является безопасным выбором. Когда образцов много, Drop-seq может быть более экономичным. Кроме этого, компания предлагает Станции для работы с единичными клетками и молекуламиChromium Controller & Next GEM Accessory Kit. Кроме всего прочего, компания предлагает Чипы, аксессуары и реагенты для создания эмульсии единичных клеток и обратной транскрипции, реагенты для подготовки библиотек к NGS. Программное обеспечение для обработки и визуализации данных Single Cell анализа. Chromium Connect (аппарат для автоматизации рабочих процессов, сокращает количество ошибок, связанных с ручным дозированием, и, по оценкам, сокращает ваше практическое время с более чем 8 часов до менее чем часа) объединяет компоненты, адаптированные для одноклеточного рабочего процесса 10x Genomics, реагенты и расходные материалы для автоматизации, а также простой в использовании компьютер с сенсорным экраном. Компаия также нацелена на работу с платформами секвестрования NovaSeq 6000/5000 (стоят 1млн$) от знаменитой компаний Illumina, Inc, которая является пионером в этой области с 1998года. Надо сказать что компания сама по себе кроме запатентованных технологий, имеет в своем арсенале аппаратные продукты и предоставляет большое количество материалов к ним, а также проводит отдельные исследования. Выручка x10 растет. Компания имеет более 700 патентов Конечно у компании есть конкуренты, среди которых Genapsys, Illimina, Pacbio, fasteris, Nanopore, Nugen, Genia, Bio-Rad и другие. Обратите внимание как выросла Pacific Biosciences of California просто Wow! Про технологии инкапсуляции можно прочитать тут https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1097276518308803