Они взяли ровно 1000. Первый покупатель покупал облигацию по номиналу. А вы уже у спекулянта перекупили по той цене, по которой сторговались. Эмитент облигации вообще не в курсе вашей сделки и ему с неё ни копейки не перепало. Он взял 1000 и вернёт 1000 тому, кто облигацию предъявит. А спекулянт немного наварился на перепродаже вам.