У меня в октябре была такая же ситуация, только на брокерском счёте. Вот что ответила техподдержка (я воспользовался вариантом 2):
Альберт, здравствуйте!
Если остались центы:
1. Центы можно вывести на валютный счет в нашем банке. Счет можно открыть в приложении Тинькофф - Открыть новый счет или продукт - Добавить валюты. До 10 000 у.е счет бесплатный. (Кнопка «шестерёнка» - Вывести - счет списания в долларах/евро). Потом уже с этого счета пополнить рублёвый брокерский счет. Конвертация пройдет по курсу нашего банка.
2. Пополнить с рублёвой карты брокерский счет в долларах/евро до 1 шт. "Счет списания" - счет Тинькофф блэк в рублях, "Счет зачисления" - брокерский счет в долларах/евро. Конвертация пройдет по курсу нашего банка.
За продажу будет комиссия за сделку по тарифу.
Комиссий за пополнение/снятие нет. При выводе может удерживаться налог, если есть прибыль.